Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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