Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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