Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF239Q16600 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF239Q16600 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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