Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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