Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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