Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms