Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARHGEF6Q15052 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms