Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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