Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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