Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAPQ14761 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms