Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IHHQ14623 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IHHQ14623 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IHHQ14623 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IHHQ14623 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IHHQ14623 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IHHQ14623 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms