Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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