Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms