Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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