Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
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SHROOM2Q13796 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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SHROOM2Q13796 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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SHROOM2Q13796 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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