Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms