Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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