Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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