Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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