Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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