Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms