Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PTPN13Q12923 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PTPN13Q12923 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PTPN13Q12923 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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