Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX10Q12887 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms