Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCB1Q12824 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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