Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms