Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms