Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms