Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms