Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms