Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms