Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms