Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms