Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELF3P78545 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELF3P78545 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms