Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms