Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA4AP68366 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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