Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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