Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCDC1P59894 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCDC1P59894 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms