Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PROK1P58294 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PROK1P58294 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PROK1P58294 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms