Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms