Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms