Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME5P56597 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME5P56597 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME5P56597 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms