Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC13P55735 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms