Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MVDP53602 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MVDP53602 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVDP53602 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVDP53602 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms