Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP5P51878 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP5P51878 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP5P51878 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP5P51878 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP5P51878 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP5P51878 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms