Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLCSP50747 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLCSP50747 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLCSP50747 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms