Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPZBP47756 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms