Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSFMP43897 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms