Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA4P43681 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms