Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms