Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms